微波干燥去菌特點：時間短、速度快：常規熱力去菌是通過傳導、對流或輻射等方式將熱量從食品表面傳至內部。要達到去菌溫度，往往需要較長時間。微波去菌是微波能與食品以及細菌等微生物直接相互作用，熱效應與非熱效應共同作用，達到快速升溫去菌作用，處理時間大大縮短，各種物料的去菌作用一般在3-5分鐘。低溫去菌保持營養成分和傳統風味。微波去菌是通過特殊熱和非熱效應去菌，與常規熱力去菌比較，能在比較低的溫度和較短的時間獲得所需的去菌效果。實踐證明，一般去菌溫度在75-85攝氏度就能達到效果，此外，微波處理食品能保留更多的營養成分和色、香、味、形等風味，且有膨化效果。如常規熱力處理的蔬菜保留的維生素c是46-50%，而微波處理是60-90%，常規加熱豬肝維生素a保持為58%，而微波加熱為84%。

節約能源：常規熱力去菌往往在環境及設備上存在熱損失，而微波是直接對食品進行作用處理，因而沒有額外的熱能損耗。相比而言，一般可節電30-50%。均勻徹底：常規熱力去菌是從物料表面開始，然后通過熱傳導傳至內部。存在內外溫差。為了保持食品風味，縮短處理時間，往往食品內部沒有達到足夠溫度而影響去菌效果。由于微波具有穿透作用，對食品進行整體處理時，表面和內部都同時受到作用，所以去菌均勻、徹底。便于控制：微波食品去菌處理，設備能即開即用，沒有常規熱力去菌的熱慣性，操作靈活方便，微波功率能從零到額定功率連續可調、傳輸速度從零開始連續調整，便于控制。